冷鏈運輸過程必須依靠冷凍或冷藏等專用車輛進行，冷凍或冷藏專用車輛除了需要有一班貨車相同的車體與機械之外，必須額外在車上設置冷凍或冷藏與保溫設備。在運輸過程中要特別注意必須是連續的冷藏，因為微生物活動和呼吸作用都隨著溫度的升高而加強，如果運輸中各環節不能保證連續冷藏的條件，那么貨物就有可能在這個環節中開始腐爛變質。在運輸時，應該根據貨物的種類、運送季節、運送距離和運送地方確定運輸方法。在運輸過程中，盡量組織“門到門”的直達運輸，提高運輸速度，溫度要符合規定。為保持冷凍貨物的冷藏溫度，可緊密堆碼，水果、蔬菜等需要通風散熱的貨物，必須在貨件之間保留一定的空隙，以確保貨物的完好。

冷鏈運輸要求在中、長途運輸及短途配送等運輸環節的低溫狀態。它主要涉及鐵路冷藏車、冷藏汽車、冷藏船、冷藏集裝箱等低溫運輸工具。在冷藏運輸過程中，溫度波動是引起貨物品質下降的主要原因之一，所以運輸工具應具有良好性能，在保持規定低溫的同時，更要保持穩定的溫度，遠途運輸尤其重要