1）本身缺乏顯著性或屬于商標法律禁注禁用的詞語不能通過查詢來判斷其申請注冊是否能被核準；2）如有在先申請的相同或近似商標在查詢時還未進入商標局數據庫，因兩者時間相近會使查詢結果無法反映；3）如查詢報告提供了幾個可能構成近似的商標，代理人只是通過一般審查標準和經驗來做出分析，其意見僅供參考，并不能代表商標局的審查意見；4）對于組合商標，如僅查詢了商標的一部分（如中文或英文），而實際申請商標中的其它部分（如圖形）與他人的注冊商標相同或近似也會導致商標整體被駁回；5）委托人在查詢時僅提供了商標的名稱，但實際申請時所提供的商標設計稿中由于字體、色彩、結構或排列的差異，也會導致查詢結果不能wq反映相同或近似的程度。

商標國際注冊薄記載的登記內容一、商標國際注冊。商標國際注冊涉及申請人名義、地址、代理人名義、地址(若被指i定的話)，申請國際注冊的商標，商標原屬國注冊日期、注冊號，商品或服務名稱及其所在的類別，原屬國名稱，指i定保護的國家，國際注冊申請號、日期、注冊日期、注冊號等;二、商標國際注冊的變更。商標國際注冊的變更主要涉及商標所有人的各項變更，代理人的各項變更等;三、商標國際注冊的續展;四、指i定保護的駁回;五、商標的無效決定;六、某些司法或行政裁定;七、更正等。

商標權利是有地域性的：商標權利的地域性是指一個國家或地區依照其本國的商標法或本地區的商標條約所授予的商標權，僅在該國或該地區有效，對他國或該地區以外的國家沒有約束力。雖然也有商標國際組織和一些商標區域性組織，但這些組織也并不能脫離商標的地域性而存在。

避免在國外無意或被動侵犯他人商標權利，導致支付巨額賠償費:大多數國家都實行申請在先原則，保護在先申請注冊的商標。如果企業出口前沒有考慮商標注冊及查詢等問題，很有可能都不知道自己已經侵犯他人在該國的商標權；一旦已有他人在先注冊，很可能會有被動侵權及面臨跨國訴訟和巨額賠償的風險。