但生物肥沒(méi)有環(huán)境污染，有利于保護(hù)生態(tài)環(huán)境，而且生物肥料的有些作用和生態(tài)效益是化肥所不具備或不可替的。一種好的生物肥料在有效活菌數(shù)、含水量、PH值、吸附劑顆粒細(xì)度、有機(jī)質(zhì)含量、雜菌率以及有效保存期等方面都有嚴(yán)格的要求。根據(jù)中國(guó)NY227－94農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定，液體生物肥料每毫升應(yīng)含5億～15億個(gè)活的有效菌。固體生物肥每克含活的有效菌為1億～3億個(gè)，含水量20%～35%為宜，吸附劑細(xì)度在0.18毫米左右，吸附劑的細(xì)度越細(xì)吸附的有效菌就越多。
根結(jié)線蟲(chóng)的發(fā)生原因及規(guī)律：過(guò)量盲目施肥造成土壤有益菌減少，有害菌增多，土壤酸化，是線蟲(chóng)發(fā)生的促進(jìn)因素。土壤酸度越大，線蟲(chóng)危害越嚴(yán)重，尤其是過(guò)量施用未腐熟的鮮雞糞的老棚發(fā)病重。線蟲(chóng)在土壤中可存活3～5年，土壤溫度25～30℃，土壤濕度40%時(shí)，線蟲(chóng)發(fā)育于40℃或低于10℃，幼蟲(chóng)停止活動(dòng)，致死溫度為55℃10分鐘，在27℃時(shí)完成一需25～30天，分布在5～50厘米的深層土壤中，隨著溫度濕度變化及殺蟲(chóng)劑的施用，可在土壤中驅(qū)避性移動(dòng)。

微生物肥料在解決這方面問(wèn)題上有獨(dú)到的作用。所以，根據(jù)我國(guó)作物種類和土壤條件，采用微生物肥與化肥配合施用，既能保證增產(chǎn)，又減少化肥使用量，降低成本，同時(shí)還能改善土壤及作物品質(zhì)，減少污染。

改良土壤作用。微生物肥料中有益微生物能產(chǎn)生糖類物質(zhì)，與植物粘液，礦物膠體和有機(jī)膠體結(jié)合在一起，可以改善土壤團(tuán)粒結(jié)構(gòu)，增強(qiáng)土壤的物理性能和減少土壤顆粒的損失，在一定的條件下，還能參與腐殖質(zhì)形成。所以施用微生物肥料能改善土壤物理性狀，有利于提高土壤肥力。