抗病抑蟲效應 主要表現在3個方面：有些微生物肥料的菌種接種作物后，由于在作物根部大量生長繁殖形成優勢種群，除了自身的作用外，還能抑制或減少病原微生物的繁殖機會，有的本身就有拮抗病原微生物的作用。建立良好的市場管理秩序，政管理部門必須加大登記管理和打擊假冒偽劣產品的力度，創造良好的社會環境。要加強對生物肥料的質量監督，保證其生產質量，提高市場監督員的專業知識水平，阻止偽劣假冒生物肥料流入市場。
配方科學、養分齊全。生物有機復合肥料一般是以有機物質為主體，配合少量的化學肥料，按照農作物的需肥規律和肥料特性進行科學配比，與生物“活化劑”wm組合，除含有氮、磷、鉀大量營養元素和鈣、鎂、硫、鐵、硼、鋅、硒、鉬等中微量元素外，還含有大量有機物質、腐殖酸類物質和保肥增效劑，養分齊全，速緩相濟，供肥均衡，肥效持久。
生物肥與化學農藥的本質區別是，后者往往重在“治標”，出了問題才被動采取對策，而生物肥則是“標本兼治”，著重從根本上改善土壤生態環境，調整土壤微生物的種群結構，營造一個不利于發病而利于作物生長的土壤生態環境，寓治于防，達到“以正壓邪”的目的其施用量一般不大，在其生產過程中所消耗的能量也很少，且施用生物肥料的同時還可減少化肥的施用量，因而節約了施肥成本。所以，生物肥料必須是在施足有機肥和適量化肥的基礎上才能發揮出其增產效果，或者說生物肥料只能是作為輔助肥料，而不能替化肥和有機肥。