生物肥與化學(xué)農(nóng)藥的本質(zhì)區(qū)別是，后者往往重在“治標(biāo)”，出了問題才被動(dòng)采取對策，而生物肥則是“標(biāo)本兼治”，著重從根本上改善土壤生態(tài)環(huán)境，調(diào)整土壤微生物的種群結(jié)構(gòu)，營造一個(gè)不利于發(fā)病而利于作物生長的土壤生態(tài)環(huán)境，寓治于防，達(dá)到“以正壓邪”的目的其施用量一般不大，在其生產(chǎn)過程中所消耗的能量也很少，且施用生物肥料的同時(shí)還可減少化肥的施用量，因而節(jié)約了施肥成本。所以，生物肥料必須是在施足有機(jī)肥和適量化肥的基礎(chǔ)上才能發(fā)揮出其增產(chǎn)效果，或者說生物肥料只能是作為輔助肥料，而不能替化肥和有機(jī)肥。
還有些廠家在生物肥料中加入不適量的化肥或其它添加劑，使肥料中化肥的氮、磷、鉀含量過高導(dǎo)致有效菌死亡，而失去生物肥的作用。因此在選用生物肥料時(shí)要注意產(chǎn)品質(zhì)量，防止假冒偽劣產(chǎn)品，以避免給農(nóng)業(yè)生產(chǎn)帶來不應(yīng)有的損失。 正確、合理的使用方法是發(fā)揮生物肥料作用的重要保證，要根據(jù)不同作物和當(dāng)?shù)氐耐寥罈l件等具體情況來選用不同的生物肥料。生物肥料常用于拌種、作基肥和追肥等，在使用方式上，生物肥可作葉面噴施，沾根等。總之，生物肥是發(fā)展起來的一類特殊肥料，農(nóng)民朋友在應(yīng)用中要不斷總結(jié)經(jīng)驗(yàn)，注意方法，使生物肥料在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中起到應(yīng)有的作用。

有機(jī)肥是全營養(yǎng)性肥料，有利于平衡增加土壤養(yǎng)分含量，改善土壤結(jié)構(gòu)及透氣保水性，改善土壤微生態(tài)系統(tǒng)，增加土壤有益微生物。因此，將現(xiàn)有的有機(jī)物資源充分利用起來，用科學(xué)的方法轉(zhuǎn)化成優(yōu)質(zhì)有機(jī)肥，是解決資源浪費(fèi)、環(huán)境污染及改良土壤的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。

根據(jù)對世界以及中國農(nóng)業(yè)形勢的分析，我國未來的農(nóng)業(yè)只能依靠科技，保障食物安全、生態(tài)安全與農(nóng)民增收，走現(xiàn)集約化的可持續(xù)農(nóng)業(yè)之路。