微生物的培養方法有三種，即純培養法、選擇性培養法和優勢培養法。

（1）原種培養 接種后的試管原種，置于25℃左右的恒溫箱中培養，經過2-3天即可檢查生長情況，純潔菌種經過7-15天的培養，原種菌絲即可長滿斜面培養基。 （2）母種及栽培種培養 栽培種接種后置于25℃左右的培養室內培養。當菌種瓶中菌絲體伸入培養基的1/3時，培養室內的溫度可降低2-3℃，以避免菌絲生長謝加強，料溫上升而引起高溫障礙。培養室內保持60-70%的空氣相對濕度。一般經過20-40天的培養，菌絲即可擴散生長到整個培養基，再經過7-10天即可培養出優質的菌種。

食用菌作為國際公認的健康食品，在國內外市場極為暢銷，每噸售價達4000—10000元人民幣，價格看好，效益可觀。有人預測21世紀的食品重點是保健食品和功能食品，而食用菌正是保健食品的佼佼者，它無疑具有廣闊的發展前途。  目前發達國家年人均占有蘑菇量已達20公斤，而我國僅5公斤。隨著人們生活水平和科學膳食意識的不斷提高，食用菌市場發展潛力很大。因此，開發食用菌產業具有廣闊的市場前景和良好的經濟效益。工廠化周年栽培食用菌是近年來迅速發展起來的現化食用菌生產技術，其特點為工廠化周年生產，實行環境控制智能化，生產操作自動化，產品質量標準化。周年生產使周年供應成為可能，尤其是反季節生產，使人們在一年四季都可吃到新鮮菇類食品，從而提高經濟效益。